Bioinformatics｜沙特阿卜杜拉国王科技大学高欣团队：基于生成式预训练Transformer的大环肽从头设计

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大环肽因其独特的化学结构和生物活性，近年来成为药物开发中的研究热点。这类肽类化合物不仅具有出色的靶向性，还能够通过与蛋白质表面的特定结合位点进行高效作用，展现出优异的药物潜力。尤其在抗肿瘤、抗感染等领域，大环肽已被证明能够穿透细胞膜并对抗复杂的疾病。然而，由于大环肽的化学结构复杂，传统的设计方法耗时且成本高昂，难以满足快速发展的药物开发需求。因此，开发基于计算方法的大环肽设计工具具有重要的实际意义。 近年来，生成模型特别是基于深度学习的生成预训练Transformer (Generative Pre-trained Transformer, GPT) 在生物分子设计中的应用取得了显著进展。沙特阿卜杜拉国王科技大学高欣教授团队通过引入分子层次编辑语言 (Hierarchical Editing Language for Macromolecules ，HELM) 与GPT模型的结合，开发了一种新的大环肽设计方法 ………………………………