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肺的正常上皮细胞可以分成这5群

单细胞天地  · 公众号  ·  · 2021-04-11 20:00

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绝大部分的肿瘤研究单细胞研究我介绍过 CNS图表复现08—肿瘤单细胞数据第一次分群通用规则 ,这个第一次分群规则是 : immune (CD45+,PTPRC), epithelial/cancer (EpCAM+,EPCAM), stromal (CD10+,MME,fibo or CD31+,PECAM1,endo) 这样 拿到的上皮细胞我们通常是走inferCNV去看其恶性与否,但是其实正常的上皮细胞仍然是可以细分亚群,比如标题是:《Decoding the multicellular ecosystem of lung adenocarcinoma manifested as pulmonary subsolid nodules by single-cell RNA sequencing》,访问链接是:https://advances.sciencemag.org/content/7/5/eabd9738 ,发表在 Science Advances 27 Jan 2021: 来自于正常的肺的上皮细胞约2000个,可以分成如下所示的5个亚群: alveolar type I cell (AT1; AGER +) alveolar type II cell (AT2; SFTPA1) secretory club cell (Club; SCGB1A1 +) basal airway epithelial cells (Basal; KRT17 +) ciliated airway epithelial cells (Ciliated; TPPP3 +) 可以看到,基 ………………………………

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