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今天给同学们分享一篇生信文章“ USP21 deubiquitinates and stabilizes HSP90 and ENO1 to promote aerobic glycolysis and proliferation in cholangiocarcinoma ”,这篇文章发表在 Int J Biol Sci 期刊上。 结果: SP21在CCA组织中上调表达,并与预后不良相关 人类拥有50多种USP家族去泛素化酶,使得这类DUBs成为最大的 11 。为了探索它们在CCA中的功能,作者根据TCGA数据集绘制了基于差异表达基因的热图(图1A)。然后,对人类CCA样本进行基因组分析,通过癌细胞富集的方式发现USP21在所有病例中的扩增率最高(图1B) 12 。为了确定在USP家族中对CCA发展起关键作用的基因,作者结合了TCGA和GEO数据库(GSE26566,GSE45001),探索上调基因,并在三个数据集中设定统一的标准(Log2FC>1,P < 0.01)。最终,作者确认USP21是唯一一个在这三个数据集中同时高表达的基因(图1C;补充图1A-C)。然后,作者
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