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单基因串扰TME的终极思路,毕业人手必备

生信精准科研  · 公众号  ·  · 2024-06-19 23:28
    

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亲爱的小伙伴们,又到了打工人最喜欢的周一啦 今天给大家分享一个超级棒的单基因研究思路,毫不夸张的说这个思路多看一会儿都忍不住动手。 课题设计、生信分析  扫码咨询 摘要   胃癌(GC) 患者对免疫治疗反应可归因于TME的复杂性。谷胱甘肽(GSH)代谢显著影响胃癌的起始和进展,靶向GSH代谢有望提高免疫检查点抑制剂(ICIs)的有效性。 文章通过一系列生信分析手段确定了GGT5作为GSH代谢中的关键基因,具有促进胃癌的潜力。 结合CIBERSORT、ssGSEA和单细胞队列分析,揭示了GGT5与记忆CD8+T细胞之间的强烈关联。此外,10名接受免疫治疗胃癌患者队列mIHC实验也证明了GGT5和记忆CD8+T细胞相关性。 研究结果建立了GGT5表达、记忆CD8+T细胞的富集以及免疫治疗反应不佳之间的正相关性。 研究流程图     图1 结果 1、发掘胃癌中的谷胱甘肽(GSH)代谢特 ………………………………

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