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Nat Met | 细胞间信息流动机制重磅成果-图形因果模型FlowSig解析单细胞转录组与空间转录组

单细胞测序网  · 公众号  ·  · 2024-09-02 08:31

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导语 细胞间通过生化信号传导交流以进行生物活动。细胞间信号的流入涉及转录因子(TF)及其下游靶标的细胞内基因调控机制,再生成流出信号,从而调节各种生命活动以维持生物稳态。 流入信号和流出信号之间构成了“因果关系”,一旦这些关系受到干扰,便会破坏生物稳态,导致疾病发生。因此,解开这些细胞间信息流动机制对于了解健康和疾病至关重要。目前尚不清楚流入与流出信号之间的接收处理机制。 单细胞测序网讯: 2024年8月26日,美国加州大学欧文分校 Qing Nie团队 在 Nature Methods 上发表了题为 “Inferring pattern-driving intercellular flows from single-cell and spatial transcriptomics” 的研究论文,介绍了一种利用单细胞转录组和空间组学数据分析细胞间通讯信息流动的方法——FlowSig。该方法可以描述细胞间通讯网络或偶联基因模块的高维基因表达 ………………………………

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