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ifnb数据集分析及注释对比

生信漫漫学  · 公众号  ·  · 2024-10-08 09:30

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写在开头 前段时间整理 #学徒笔记 的时候,突然发现居然 单细胞2024系列课程里面,有个代码合集我没有理解跑通! 所以赶紧好好运行学习一下这一系列的代码,我 就说怎么好像学徒笔记里面有块内容好像见过又好像没见过呢! step1-run-basic 第一个脚本就是基础的降维聚类分群的代码,除了数据集使用到的是公共数据 ,这一点区别外,和别的分析流程是一样的。 详细的代码介绍在: 单细胞多样品标准流程代码-1 以及 单细胞多样品分析2-标记基因与细胞注释 之前的学徒已经对代码进行了详细的整理与介绍,那我就 从个人角度来简单记录下分析过程中的数据以及结果叭! 加载示例数据集 清空环境加载需要的R包 rm(list=ls()) options(stringsAsFactors = F)  source ( 'scRNA_scripts/lib.R' ) 将常用的R包整理到脚本里面,就可以省去每次都要加载一长串R包的麻烦,直 ………………………………

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