BioGRID——给你提供转录组挖掘新思路

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基因/蛋白间的相互作用一直是转录组的研究热点，在上一期我们介绍了耳熟能详的蛋白互作数据库——STRING（ 戳这里查看 ） ，今天，我们再分享一个热门基因蛋白互作数据库—— BioGRID [ https://thebiogrid.org/ ] 目前最新版的BioBRID数据库（4.4.237），利用 文献挖掘 （包括重点低通量研究和大型高通量数据集），已经收集了 2,800,228 个蛋白质和遗传相互作用、 31,144 个化学 相互作用和 1,128,339 个翻译后修饰。值得注意的是，这个数据库几乎每个月都会更新，因此在使用BioGRID进行预测时，一定要记住当前使用的版本。 BioBRID数据的界面非常简洁友好，在官网首页，左侧展示了当前最新的版本信息，右侧为搜索框，在这里搜索可以搜索 基因/蛋白名称 、 PubMed ID 或 化学物质名称 。 点击Submit Identifier Search，开始检索，结果界面如下： 结果界面主要分为上下 ………………………………