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假阴性?可能是参考基因组没用对!

豌豆田  · 公众号  ·  · 2024-12-17 11:06
    

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2014 年 12 月 9 日的文章通过两个临床案例展示,使用 T2T-CHM13 参考基因组可以显著提高关键 SV 的得分。 尽管有技术进步,但缺少精确的参考基因组限制了潜能的发挥,GRCh38 参考基因组存在未解决序列和GAP间隙。 案例 1:通过 OGM 光学图谱 对血液病患儿进行结构变异分析,找到 F8 基因内含子 22 反转(Int22Inv)。在第一个病例中,一名男性儿童因VIII因子缺乏而被诊断为严重血友病。基于PCR的内含子22反转检测为假阴性,导致对该患者进行了全外显子组测序(WES),但WES未能在F8基因中识别出任何已知的致病性/可能致病性变异。为了进一步调查该患者血友病A的原因,进行了OGM以识别任何致病性结构变异。 案例 2:通过 Trio OGM 分析确认 4 岁儿童的染色体易位事件。在第二个病例中,一名4岁男性儿童表现出全面发育迟缓、面部畸形和自闭症谱系障碍特 ………………………………

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