通过G蛋白偶联受体相关基因分析探索肝细胞癌的预后和治疗标志物

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今天给同学们分享一篇生信文章“ Exploration of prognostic and treatment markers in hepatocellular carcinoma via GPCR-related genes analysis ”，这篇文章发表在 Heliyon 期刊上。 结果： GPCR相关基因在HCC患者中的表达和突变改变 研究工作流程如图1所示。首先，从TCGA-LIHC的RNA测序（RNA-seq）数据中提取了770个与GPCR相关的基因，并比较了HCC和正常肝组织的表达差异。在单变量Cox回归分析之后，观察到这770个GPCR相关基因中有38个基因表达差异显著，并且几乎所有这些基因在HCC中过度表达（图2A），这表明这些基因可能在HCC的肿瘤发生中起着重要作用。然后，使用maftools软件包提取了这38个GPCR相关基因的突变信息，并发现它们的SNP突变频率普遍较低（图2B）。以上结果表明，这些GPCR相关基因可能在转录或转录后水平上发挥重要作用。 HCC GPCR亚型的鉴定 基于与GPCR相关的上述DEGs，使 ………………………………