一文了解单细胞染色质及常见分析

文章预览

一、写在前面 scRNA-seq 能够帮助我们解析细胞特异性表达模型，但基因调控的过程( SCENIC 可以通过表达量来反推，但无法直接观察到)与染色质活动情况则是这项技术的盲区。我们都知道，细胞内的调控往往存在级联放大效应，对于染色质景观的研究更利于我们理解生物学现象，而染色质可及性便是其中的一种重要手段。在基因的表达过程中，染色质可及性会发生一系列的改变，通过暴露不同的启动子、增强子和其它顺式调控元件(这个过程中就涉及染色质可及性的改变)，可以使转录因子能够结合在染色质上调节相应基因的表达。染色质可及性（chromatin accessibility）是指染色质中DNA序列的可接触性和可转录性的程度。它涉及DNA如何被包裹在组蛋白和其他染色质蛋白质中，从而影响基因的表达和转录。染色质可及性越高，DNA区域越容易被转录因子和其他 ………………………………