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4+PPI+分型+机器学习+孟德尔,满满的学习思路,赶紧学起来!!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-08-26 18:19

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Exploring the relationship between anal fistula and colorectal cancer based on Mendelian randomization and bioinformatics”,这篇文章发表在 J Cell Mol Med 期刊上。 结果: 肛瘘和结直肠癌核心枢纽基因的筛选 与肛瘘和结直肠癌相关的基因与从疾病数据库中GSE134834获得的结直肠癌中差异表达的基因相交,产生14个交叉基因(图1安培).在STRING网站上进行蛋白质-蛋白质相互作用分析(置信度=0.04),在此基础上,在Cytoscape软件(使用cytoHubba插件)中选择核心枢纽基因,共得到 < >个核心枢纽基因(图1B,C). 功能富集分析 细胞成分主要分为膜相关成分、细胞质相关成分和细胞外基质相关成分。细胞外基质相关成分包括含有胶原蛋白的细胞外基质、血小板α颗粒和管腔。分子功能主要涉及信号转导、细胞生长和蛋白质修饰。生物功能包括生物体 ………………………………

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