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转录组的WGCNA结果如何与代谢组关联?

基迪奥生物  · 公众号  ·  · 2024-08-23 18:00

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转录组分析能揭示上万种基因的表达模式变化,代谢组能揭示代谢物积累的变化,二者通过KEGG注释和富集分析,可以共同揭示如糖代谢等途径的变化。除此之外,也可以考虑用WGCNA将二者关联起来。WGCNA依据基因相似的表达模式,将上万基因归类到十几个模块中,与代谢组学中关键通路的显著变化代谢物丰度作为性状数据进行相关性分析,从而找到与关注的代谢过程最相关的模块,并构建共表达调控网络,鉴定关键基因和转录因子。让我们以一篇基迪奥客户文章为例,看一下这种思路的实际应用。 中文题目: 结合转录组学和代谢组学分析,揭示PEG诱导的干旱胁迫下青钱柳幼苗糖代谢的响应机制 合作单位: 南京林业大学 IF(2023): 6.1/Q1 研究背景 青钱柳是一种多功能树种,用于功能性食品和有价值的木材生产。本文重点研究了PEG诱导的干旱胁迫对青 ………………………………

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