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WGCNA联合单细胞加实验,请自行查阅!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-11-22 17:52

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“Deciphering the molecular regulatory of RAB32/GPRC5A axis in chronic obstructive pulmonary disease”,这篇文章发表在 Respir Res s期刊上,影响因子为4.7。 结果: Hub Rabs 的基因共表达网络构建与鉴定 从 GEO 数据库中获得了四个公开可用的 COPD 微阵列数据集 (GSE5058、 GSE10006、 GSE11784 和 GSE20257) 用于进一步分析。这些数据集是在 GPL570 平台上生成的,因此,使用 SVA 包去除了批量效应,以进行全面的组合分析。在排除诊断模糊或重复的样本后,共有 30 名 COPD 患者和 163 名非 COPD 对照受试者参与了本研究。使用 WGCNA 方法探索了 COPD 发生背后的复杂调节过程。为了构建无标度网络,应用了 6 的软阈值,使用 TOM 检测鉴定基因模块,从而鉴定出 模块。基因模块与 COPD 特征之间的关联分析表明,MEgreenyellow 模块与 COPD 的相关性最强 ,除 ME ………………………………

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