7+脂质代谢+机器学习+实验+分型，手把手教你玩转代谢相关的生信思路！！

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“Effects of Lipid Metabolism-Related Genes PTGIS and HRASLS on Phenotype, Prognosis, and Tumor Immunity in Lung Squamous Cell Carcinoma”，这篇文章发表在Oxid Med Cell Longev期刊上，影响因子为7.31。 脂质代谢相关差异表达基因的鉴定和突变景观 该研究的工作流程图如图1所示。3D PCA图显示TCGA数据集中的498个LUSC样本和GTEx数据集中的288个正常肺组织样本明显独立（图2(a)）。通过使用筛选阈值为|log2FC| > 1和p值 < 0.05，鉴定出了191个与脂质代谢相关的差异表达基因（DEGs），其中包括116个下调基因和75个上调基因（图2(b)和2(c)）。然后，作者总结了LUSC中191个DEGs的体细胞突变发生率。在409个LUSC患者中，228个（55.75%）发现了遗传突变（图2(d)和2(e)）。图2(d)显示了LUSC中具有前20个突变率的DEGs的突变景观。错义突变是最高分类的变异类型。单核苷酸多态 ………………………………