10X Visium上游定量过程

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1 软件简介 Space Ranger是10x 公司为空间转录分析量身打造的一款数据分析软件，一般会用它来完成上游的分析步骤，主要用来处理Visium空间基因表达数据与明场和荧光显微镜图像，将测序数据和图片作为输入的数据，输出表达定量矩阵，为下游的seurat包提供整合之后的数据。也结合配套的loupe软件，做一些降维，聚类结果的可视化。 官网： https://www.10xgenomics.com/support/software/space-ranger/latest 如果你对下面的教程比较迷茫，那么你可以先行学习 Linux教程： 十小时学会Linux 生信Linux及服务器使用技巧 如果你的计算机不足以支持下面流程的学习，可按需选用适合自己的计算资源： 共享(经济实惠)： 有root权限的共享服务器,报我名字立减200￥ 独享(省电省心)： 生信分析不求人 实体( 稳定高效 )： 为实验室准备一份生物信息学不动产 访问链接(复制到浏览器打 ………………………………