单细胞分析之Monocle 3官网教程-1-介绍安装及初探

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官网首页 本次分享目录 教程地址：https://cole-trapnell-lab.github.io/monocle3/docs/introduction/ 介绍 单细胞转录组测序（sc-RNA-seq）实验使我们能够发现新的细胞类型，并帮助我们理解它们在发育过程中的形成。Monocle 3软件包提供了用于分析单细胞基因表达实验的工具包。 Monocle 3可以帮助您执行三种主要类型的分析： 聚类、分类和计数细胞。单细胞RNA测序实验使您能够发现新的（可能是罕见的）细胞亚型。Monocle 3帮助您识别它们。 构建单细胞轨迹。在发育、疾病和整个生命周期中，细胞从一种状态过渡到另一种状态。Monocle 3帮助您发现这些过渡。 差异表达分析。对新细胞类型和状态的表征始于与其他更为了解的细胞的比较。Monocle 3包括一个复杂但易于使用的差异表达系统。 要了解Monocle核心算法的更多信息，或者学习如何使用单细胞RNA测序来研究复杂的生 ………………………………