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组学数据富集到一条“奇奇怪怪”的通路,导师坚持让我做细胞鉴定,我真无语了……

猫头鹰教室  · 公众号  ·  · 2025-02-07 11:00
    

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KEGG 信号通路是组学数据分析中最常见的一个,大家多少都见过了: 大家可能遇到过这个现象:在 KEGG 通路富集结果中,经常会出现一些“奇奇怪怪”的通路,之所以说是“ 奇奇怪怪 ”, 就是因为有些通路明显是与研究主题不相关的。 今天这个“故事”就是小 A 在研究中遇到的,小 A 关注的是 X 基因通过调控 Kupffer 细胞衰老参与肝缺血再灌注损伤的作用机制 ,前期已经筛选到一个新基因 X ,并且在 Kupffer 细胞中对 X 进行基因沉默后做的功能富集,结果就拿到了上面组学富集的结果,小 A 就在课题组汇报的时候直接把上面的图贴到 PPT 里面了。汇报的时候,导师看到这个结果后,提了一个问题: COVID-19 通路富集的很靠前,你这细胞是不是被污染了?你先检测一下是不是被污染了。 要是证明 COVID-19 感染相关通路与肝缺血再灌注损伤的关系,说不定 ………………………………

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