文献分享 ｜Nat. Cell Biol.｜SPATAC-seq在单细胞分辨率下绘制斑马鱼胚胎发育的染色质可及性图谱

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大家好！为大家介绍一篇2024年发表在 Nature Cell Biology 的文章，题目为“ Mapping the chromatin accessibility landscape of zebrafish embryogenesis at single-cell resolution by SPATAC-seq ”。本文中，作者发展了一种基于拆分混合的转座酶可及染色质测序方法SPATAC-seq，构建了斑马鱼胚胎发育单细胞开放染色质图谱（ZEPA），鉴定了发育特异的潜在顺式调控元件（cCRE）。本文的通讯作者是清华大学的孟安明教授，研究方向为脊椎动物胚胎早期发育的分子机制。 课题组网站：https://www.life.tsinghua.edu.cn/info/1031/1254.htm 背景介绍  研究细胞分化的基因调控网络是发育生物学的主要目标，斑马鱼是研究胚胎发育的模型动物，目前已有许多关于其表观基因组和转录组的研究，在发育中的斑马鱼基因组中发现了数百种细胞类型和丰富的功能元件，但染色质可及性的相关研究较缺乏。 设计思路 ………………………………