Nat. Methods | 不同样品制备方法对自上而下蛋白质组学鉴定的影响

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大家好，今天给大家分享一篇发表在 Nature Methods 上的文章： Influence of different sample preparation approaches on proteoform identification by top-down proteomics ，通讯作者是德国基尔大学的 Andreas Tholey 教授，他的研究方向主要聚焦于开发基于质谱的生物分子分析方法。 在这篇文章中，作者对自上而下蛋白质组学的不同样品制备流程进行了系统性研究。 与将蛋白质消化为肽段进行检测的自下而上的蛋白质组学相比，自上而下的蛋白质组学（TDP）鉴定完整的蛋白质形式，因而可以揭示蛋白质组完整的复杂性。然而目前，TDP在样品制备、蛋白质分离、质谱分析和数据库搜索等各个阶段仍然面临很多挑战。 其中，作者关注到目前已经报道了各种TDP样品制备流程，它们在细胞裂解、样品净化、分离和纯化合适质量的蛋白质形式等步骤上各有不同。因此作者希望评估这些样品 ………………………………