单基因富集分析

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关注公众号，发送 R语言 或 python ，可获取资料 💡专注R语言在🩺生物医学中的使用 设为“ 星标 ”，精彩不错过 前面给大家介绍了这么多的富集分析，其实主要就是两种： ORA 和 GSEA 。通常都是需要一个基因集才可以做。 单个基因能做富集分析吗？肯定是不行的，所以需要我们用间接的方法实现。 对于单基因，你如果要做富集分析，有两种思路： 批量计算和这个基因相关的其他基因，把其他基因进行富集分析，这个富集分析结果就可以近似的看做是单基因的结果 根据这个基因的表达量进行分组，然后做差异分析，用差异基因做富集分析，这个富集结果，也是基于单基因的富集 这个思路同样也适用于其他分子，比如lncRNA，比如miRNA（miRNA其实应该是找靶基因做，这样更合理）。 下面我们进行演示，我们选择 HOPX 这个基因，来自一篇文章：https://d ………………………………