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bioconda是非常流行的生物数据分析环境管理工具,可以用来安装管理生物信息软件。是生物信息软件的AppStore。默认采用交互式安装方式,只需要四步简单的Enter,yes,Enter,yes即可完成安装。但很多新手容易安装错误,其实bioconda也可以采用非交互式安装,这次内容我们来简单介绍一下。 直接运行脚本是采用交互式运行,可以添加命令行选项参数-h获取帮助信息。软件仅有几个参数。这里我们直接选择mamba工具Miniforge3. (base) bioinfo 07:55:41 ~ $ sh /share/Software/Miniforge3-24.7.1-2-Linux-x86_64.sh -h usage: /share/Software/Miniforge3-24.7.1-2-Linux-x86_64.sh [options] Installs Miniforge3 24.7.1-2 -b run install in batch mode ( without manual intervention), it is expected the license terms ( if any ) are agreed upon -f no error if install prefix already exists -h print this help message
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