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推陈出新,PDTX模型预测肿瘤预后

生信人  · 公众号  · 生物  · 2024-08-16 07:00
    

主要观点总结

本文基于患者来源的肿瘤异种移植物(PDTX)模型,研究了胃癌(GC)的转录组特征,特别是与细胞外基质(ECM)相关的特征。通过PDTX模型,作者探讨了肿瘤发生组和非肿瘤发生组的差异,并寻找与预后相关的基因特征。主要结果包括PTG评分模型的构建和验证,以及与免疫细胞浸润和临床特征的相关性研究。

关键观点总结

关键观点1: 患者来源的肿瘤异种移植物(PDTX)模型用于研究胃癌的转录组特征。

通过比较肿瘤发生组和非肿瘤发生组,揭示了与细胞外基质(ECM)相关的转录组特征。构建了PTG评分模型,该模型在训练和验证队列中均表现出良好的预后预测能力。

关键观点2: PTG评分与免疫细胞浸润和临床特征的相关性。

研究发现PTG评分高的患者表现出较差的预后,与免疫细胞浸润模式相关。特别是在高PTG评分组中,M2巨噬细胞浸润较高,并且CAFs的比例也较高。

关键观点3: 列线图的构建和验证。

基于独立预后分析,建立了整合列线图来预测GC的OS。该列线图在训练集和验证集中的预后预测均表现出较高的准确性。


文章预览

小伙伴们大家早上好,今天小编和大家分享的文章题目是“患者来源的肿瘤异种移植物的转录组提供新的用于预测胃癌预后的细胞外基质相关特征”,是近期发表在 《Journal of Translational Medicine》(IF:7.4) 杂志上,本文主要通过肿瘤异种移植瘤(PDTX)模型来研究肿瘤发生组和非肿瘤发生组的差异,并找寻细胞外基质(ECM)相关转录组特征进行模型的构建,让我们一起来学习吧! 摘要 胃癌(GC)个性化治疗方法发展的一个主要障碍是肿瘤内、患者内和患者间水平的普遍异质性。虽然病理分期和组织学亚型的诊断可以近似地预测预后,但胃癌的异质性很少被考虑。细胞外基质(ECM)是肿瘤微环境(TME)的主要组成部分,它广泛地与肿瘤和免疫细胞相互作用,为研究GC异质性提供了一个可能的解决办法。然而,ECM由许多蛋白质成分组成,目前还没有合适 ………………………………

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