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PNAS | 陈洛南团队发布数据降维新方法 : DTNE

BioArt  · 公众号  · 生物  · 2025-02-02 17:30
    

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2025年 1月24 日,广东省智能科学与技术研究院 陈洛南 团队在 Proceedings of the National Academy of Sciences ( PNAS) 在线发表了题为  Diffusive topology preserving manifold distances for single-cell data analysis  的研究论文, 提出了一种新型流形学习算法 : Diffusive Topology Neighbor Embedding ( DTNE ) , 可实现数据拓扑结构保持的降维和流形表征。该算法基于扩散过程,能够在高噪声数据中精确捕捉细胞间的几何结构和低维流形,为高维数据特别是单细胞数据分析提供了精准的工具。          单细胞测序数据蕴含着丰富的细胞状态和类型信息,但其高维度、噪声干扰以及复杂拓扑结构给数据解析带来了极大挑战。现有分析工具 (如t-SNE、UMAP) 虽在降维和可视化任务中广泛应用,但在捕捉细胞间真实关系以及全局拓扑结构方面仍显不足。针对上述挑战,研究团队开发了DTNE算法 ………………………………

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