代谢组学的整洁分析流程-tidymass-8-代谢物注释流程

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简介 在 tidyMass 中， metid 包用于基于内部数据库和公共数据库进行代谢物鉴定，依据的参数包括质荷比 (m/z)、保留时间 (RT) 和/或 MS2 光谱。 安装 你可以从 GitLab 安装 metid ： if (! require (remotes)){ install.packages( "remotes" ) } remotes::install_gitlab( "jaspershen/metid" ) 或者 github： remotes::install_github( "tidymass/metid" ) 或者 tidymass.org： source ( "https://www.tidymass.org/tidymass-packages/install_tidymass.txt" ) install_tidymass(from =  "tidymass.org" , which_package =  "metid" ) 引用 如果你在出版物中使用了 metid ，请引用以下论文： “ Xiaotao Shen, Si Wu, Liang Liang, Songjie Chen, Kevin Contrepois, Zheng-Jiang Zhu*, Michael Snyder* (Corresponding Author). metID: A R package for automatable compound annotation for LC−MS-based data. Bioinformatics, btab583, https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btab583 Shen, X., Yan, H., Wang, C. et al. TidyMass an object-oriented reproducible ………………………………