Cell |中山大学联手阿里云，LucaProt记录隐藏的RNA病毒圈

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DRUG AI 今天 为大家介绍的是来自中山大学深圳校区施莽团队联手阿里云智能飞天实验室的一篇论文。当前的宏基因组学工具可能无法识别高度变异的RNA病毒。作者开发了一种名为LucaProt的深度学习算法，用于在来自全球多种生态系统的10,487个转录组中发现高度变异的RNA依赖的RNA聚合酶序列。LucaProt结合了序列和预测的结构信息，能够精确检测RNA聚合酶序列。通过这种方法，作者识别了161,979种潜在的RNA病毒物种和180个RNA病毒超类群，其中包括许多此前研究较少的病毒类群，以及具有极长基因组（最长达47,250个核苷酸）和复杂基因组结构的RNA病毒。一部分新发现的RNA病毒通过RT-PCR和RNA/DNA测序得到了确认。这些新发现的RNA病毒存在于多种环境中，包括空气、温泉和海底热液喷口，并且其病毒多样性和丰度在不同生态系统中差异显著。本研究推进了病毒发 ………………………………