上皮细胞里面混入了淋巴系和髓系免疫细胞呢

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针对这个这个胃癌单细胞数据集GSE163558，我做了解读，详见 ： 单细胞转录组降维聚类分群过滤基因和过滤细胞的区别 。而且前面已经是完成了降维聚类分群，在 学习单细胞亚群命名的层次结构 演示了一个降维聚类分群结果，就有了  2-harmony/sce.all_int.rds 文件，以及对应的 phe.Rdata 注释信息。 在文献里面的单细胞亚群以及其对应的基因和细胞数量分别是： >  print (cell_groups)           Group Count               Genes 1    Epithelial  1743 EPCAM, KRT19, CLDN4 2       Stromal  1288 PECAM1, CLO1A2, VWF 3 Proliferative  1089  MKI67, STMN1, PCNA 4             T 24448     CD3D, CD3E, CD2 5             B  7708 CD79A, IGHG1, MS4A1 6            NK  1173  KLRD1, GNLY, KLRF1 7       Myeloid  5519  CSF1R, CSF3R, CD68 也就是说， 我把髓系免疫细胞 ………………………………