JCIM｜ 全柔性分子对齐实现精确的配体结构建模

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构建准确的蛋白质-配体结合姿态是基于结构的结合亲和力预测的先决条件，这为小分子药物设计中的先导优化提供了结构基础。然而，由于小分子化学空间的复杂性和多样性，对不同分子的结合姿态进行合理的预测是一项挑战。 本文介绍的是近期发表在《Journal of Chemical Information and Modeling》上的一篇题为《Fully Flexible Molecular Alignment Enables Accurate Ligand Structure Modeling》的文章。 在该论文中， 作者开发了一种基于相似性的分子对齐算法Z-align，该算法利用分子的拓扑结构信息作为相似性评价标准，采用了全柔性的分子优化策略，从而实现精确的配体分子结构建模。 该论文的第一作者为山东大学物理学院在读博士王志豪，共同通讯作者是郑良振博士（智峪生科）、李伟峰教授（山东大学物理学院）、彭向达博士（智峪生科）。 在小分子药物设计领域， ………………………………