韩国版AlphaFold？深度学习模型AlphaPPIMd：用于蛋白质-蛋白质复合物构象集合探索

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作者：田小幺 编辑：李宝珠，三羊 延世大学王建民博士及其合作者通过将深度学习与生成式人工智能相结合，构建 AlphaPPIMd 模型，通过分子动力学模拟揭示出蛋白质相互作用的奥秘。 在生命的舞台上，蛋白质扮演着不可或缺的角色。它们是生物体中最为活跃的分子，参与细胞的构建、修复、能量转换、信号传递以及无数关键的生物学功能。同时，蛋白质的结构与其功能密切相关，而它们的功能又通过与蛋白质、多肽、核苷酸以及各种小分子的复杂相互作用来实现。这种蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 是细胞内许多生物过程的核心，从细胞信号传导到免疫反应，再到细胞周期的调控，无不涉及 PPI。 然而，人们目前对蛋白质三维结构及其相互作用特性的了解仍不够全面。传统的实验技术，如 X 射线晶体学和冷冻电镜， 虽然能够提供高分辨率的蛋白质 ………………………………