最全面T2T基因组组装方法总结

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T2T基因组方法 随着三代测序技术的进步和基因组组装工具的更新，越来越多的端粒到端粒（T2T）甚至是完整基因组被发表。那么如何能够构建一个T2T基因组，在这里，我们重点回顾了如何构建一个T2T的组装。本文从三个角度讨论，分别是测序数据，组装工具和组装策略。 首先是测序数据，它是保证T2T基因组组装的先决条件。如果想要达成T2T组装，必须采用 三代测序为主，二代测序为辅的方法进行组装 。PacBio HiFi数据有着测序准确性高，长度长的优点，ONT数据有着超长的reads长度，在组装一些复杂的基因组区域时，如着丝粒，片段重复区域，有着天然优势，不过美中不足的是，相比较于HiFi数据，ONT数据准确性稍有欠缺。在这里，推荐大家测50×以上的PacBio HiFi和ONT ultralong，以及100×以上的Hi-C数据。基于这些数据主要有三种组装策略，分别是仅ONT数据 ………………………………