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在选购单细胞空间成像平台时,由独立研究人员领导的分析性能比较研究可能会更加客观并对您有所帮助。在此,我们将重点介绍近期的两项研究 , 分别来自加拿大的Lunenfeld-Tanenbaum研究所的Cook等人(1)和来自美国麻省理工学院和哈佛大学的Broad研究所的Wang等人(2), 他们将10x Genomics公司的Xenium原位分析与NanoString公司的CosMx空间分子成像仪和Vizgen公司的MERSCOPE平台进行了比较。 HIGHLIGHTS 重点归纳 这些研究由不同的独立研究团队开展,对不同的单细胞空间成像平台进行了深入探究,其重点在于: 比较转录本检测的特异性 使用正交技术(RNA-seq和scRNA-seq)验证分析性能 利用共有基因进行横向比较 评估细胞聚类、分割和转录本的空间分布 公开数据以便再次分析 我们在第一部分提炼了这些研究的主要成果,您也可以继续向下阅读,深入了解作者们所做的工
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