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最全植物基因组数据平台 IMP中文教程( 核基因组更新到 1000 个植物)

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2024-07-06 21:00
药用植物因其潜在的抗肿瘤、抗炎和抗氧化特性,在民族医学和传统医学中引起了极大的关注。基因组测序和合成生物学的最新进展重新激发了人们对这些天然产物的兴趣。尽管有很多药用植物的基因组和转录组测序数据,但缺乏可公开访问的基因注释和表格格式的基因表达数据,这不利于它们的有效利用。为了解决这一紧迫问题,我们开发了IMP (Integrated Medicinal Plantomics)整合药用植物组学平台(https://www.bic.ac.cn/IMP 点击阅读原文直接跳转)。IMP收录了84个高质量的基因组(预期收录所有植物的基因组,目前已收录 441 个),整理了848,565,672个基因,以及2,158个转录组测序样本,涵盖了多个器官、组织、发育阶段和胁迫刺激。通过集成的10个分析模块,用户可以简单地在IMP中探索基因的注释、序列、功能、分布和表达。IMP的开发和使用将会从基础数据 ………………………………

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