Nature Methods 前沿：空间转移张量方法解析细胞状态转变

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关键词： 空间转录组学，单细胞RNA测序，空间转移张量，吸引子，细胞命运决定   论文题目：Spatial transition tensor of single cells 论文来源： Nature Methods 论文链接：https://www.nature.com/articles/s41592-024-02266-x 在单细胞生物学中，揭示细胞状态的转变对于理解发育、疾病进程以及细胞命运决定至关重要，空间转录组学 （Spatial Transcriptomics） 和信使RNA剪接 （Messenger RNA Splicing） 为细胞状态转变编码了丰富的时空信息，然而，如何从这些复杂的数据中重建细胞的转变路径，特别是考虑到细胞在空间上的分布和多稳态特性，仍然是一个亟需解决的问题。传统的单细胞RNA测序方法如RNA速度 （RNA velocity） 依赖低维相似性推断细胞动态，虽揭示命运方向，却常忽视空间信息和多稳态复杂性，适用于单一平衡系统，在多谱系或多亚稳态的复杂组织中效果不佳。 Nature Metho ………………………………