Mol Cell | 李笑雨/伊成器团队合作开发不依赖于亚硫酸氢盐RNA m⁵C单碱基测序检测方法

文章预览

RNA 5-甲基胞嘧啶 （m 5 C） 修饰是一种保守的转录后修饰，广泛分布在rRNA、tRNA和mRNA上。mRNA上的m 5 C修饰主要由NSUN2和NSUN6等甲基转移酶催化产生，并且可以被TET家族蛋白和ALKBH1进一步氧化到hm 5 C，f 5 C和ca 5 C 【1】 。RNA m 5 C修饰可以被特定的结合蛋白所识别进而参与基因表达调控，如近年来国家生物信息中心杨运桂团队在RNA m 5 C修饰研究中取得了系列突破性成果，报道了包括ALYREF, YBX1, YBX2和SRSF2在内的多个结合蛋白及其调控功能 【2-6】 ，极大地推动了对于RNA m 5 C修饰生物学功能的理解。 对于RNA m 5 C修饰功能的探究依赖于灵敏精准的检测技术。目前RNA m 5 C修饰检测主要依赖于亚硫酸氢盐测序 （bisulfite sequencing，BS-seq） ，在BS-seq中未修饰的胞嘧啶（C）被转变为尿嘧啶（U），而m 5 C保持不变，因此通过检测未转变C即可实现对于m 5 C修饰的鉴定。 虽然BS-s ………………………………