多组学整合的实li讲解

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鉴于上次有读者要求具体讲一讲多组学整合 ， 拖延症晚期的生信人文体委员准备实力 … 额实例讲解一下具体的方法。 老师，我想学多组学整合   最近看到一篇比较古老的文章 Novel gene and gene model detection using a whole genome open   reading frame analysis in proteomics ， 2006 年发表在 Genome Biology 上 。找到这篇文章，一方面是觉得它做的很有趣，另一方面就是它内容逻辑很清晰，即便是文体委员也能感受到来自科学大佬的关爱。   文章主要想做的是结合蛋白质谱的方法来鉴别新的基因组编码区域，包括转录产物，从而改善基因注释。   为了不错过每个可能编码的区域，作者将整个基因组（ hg17 ）都使用 six reading frames 的方法进行了翻译 ， 得到了 a significant   number of protein seq ………………………………