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GPB | 宁波大学/深圳湾实验室团队合作发表增强子RNA鉴定与功能注释平台eRNA-IDO

测序中国  · 公众号  ·  · 2024-09-17 13:59
    

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增强子RNA(enhancer RNA,eRNA)是一种从增强子区域中转录而出的非编码RNA,能够在生命过程中发挥重要的调控作用,如促进增强子和启动子成环、调控RNA聚合酶II的暂停释放等。已有研究报道eRNA与疾病尤其是癌症的发生发展密切相关。然而,关于eRNA的转录位置、与其它生物分子之间的作用关系及其生物学功能仍未阐明。因此,开发一种用于有效鉴定eRNA并对其功能进行注释的生物信息学方法/平台具有重要意义。 近日, 宁波大学廖奇与深圳湾实验室李磊团队 在生物信息学期刊 Genomics , Proteomics & Bioinformatics 发表题为“eRNA-IDO: A One-stop Platform for Identification, Interactome Discovery, and Functional Annotation of Enhancer RNAs”的论文。该论文介绍了他们最新开发的综合性平台—— eRNA-IDO,这是一个集eRNA鉴定、互作组发现和功能注释于一体的一站式平台。eRNA-IDO由两个 ………………………………

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