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Cardiovasc Res丨找心衰标志物?这篇研究用公共数据库两站搞定!

观科研  · 公众号  ·  · 2024-09-05 20:00
    

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研究概览 Study Overview 糖尿病是心力衰竭的重要风险因素,心衰合并糖尿病患者全因死亡率是血糖正常心衰患者的2倍。然而,心衰与糖尿病相关的分子基础主要来源于动物模型,并不能很好的代表临床糖尿病患者的表型和治疗特点。 近日,英国利兹大学Richard M Cubbon团队在 Cardiovascular Research 杂志发表文章,通过结合GTEx数据库的糖尿病患者心肌转录组和UK Biobank数据库糖尿病患者循环蛋白水平,证实Erbb3和Hspa2是糖尿病患者发生心力衰竭的新型标志物。 研究流程图 0 1 研究方法 1.1 GTEx数据库心肌RNA-seq数据获取 GTEx数据库全称为基因型-组织表达计划(Genotype-Tissue Expression Project),该数据库包括了人体54种不同组织的遗传变异和基因表达信息。 该研究获取了数据库中425份右心耳组织和428份左室心尖组织的RNA-seq数据(bulk RNA-seq公共数据直接从GTEx portal官网下 ………………………………

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