HLA数据分析专题

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欢迎关注”生信修炼手册”! HLA 全称human leukocyte antigen, 表示人类白细胞抗原，是编码主要组织相容性复合体(MHC)的基因，位于6p21.31的区域，包含了一系列紧密连锁的基因座，与人类的免疫系统功能密切相关，本文整理了HLA数据分析相关的资料。 首先是一些基本概念和公共数据库 人类白细胞抗原-HLA简介 IMGT/HLA数据库简介 HLA Dictionary-Allel和抗原之间的对应关系 ANFD-HLA在不同人群中的频率数据库 HLA Epitope Registry-HLA抗原表位数据库 接下来是各种HLA分型软件 HLAreporter : HLA分型软件简介 HLAminer:根据NGS数据确定HLA分型结果 opitype:对HLA I型基因进行4位分型 seq2HLA:利用RNA_seq数据进行HLA分型 HLA-VBSeq:对全基因组数据进行HLA分型 使用HLAscan进行HLA分型 HLAforest:使用RNA-seq数据进行HLA分型 HLA ………………………………