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trans_array:探针表达矩阵转换为基因表达矩阵

生信星球  · 公众号  ·  · 2024-07-11 19:10
    

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 今天是生信星球陪你的 第968天     公众号里的文章大多数需要编程基础,如果因为代码看不懂,而跟不上正文的节奏,可以来找我学习,相当于给自己一个新手保护期。 我的课程都是循环开课。 下一期的时间,点进去咨询微信↓ 生信分析直播课程 生信新手保护学习 ‍ 小组 0.背景知识 1.随机去重 2.保留行和/行平均值最大的探针 3.求平均值 0.背景知识 trans_array这个函数的作用是将探针表达矩阵转换为基因表达矩阵。 因为探针和基因不是一一对应的关系,会存在多个探针对应同一个基因的情况。例如AAMDC这个基因有三个探针: rm(list = ls()) load( "exp_ids.Rdata" ) ids0 = ids[ids$symbol== "AAMDC" ,] ids0 # #          probe_id symbol # # 24890   220268_at  AAMDC # # 26046   221599_at  AAMDC # # 26047 221600_s_at  AAMDC 首先,多个探针对应同一个基因的问题是必须要处 ………………………………

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