Nat Biotechnol｜David Baker团队：基于RoseTTAFold序列空间扩散的多状态蛋白质从头设计

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2024年9月25日， David Baker 教授团队在 Nature Biotechnology 上发表研究Multistate and functional protein design using RoseTTAFold sequence space diffusion 。 研究的核心目标是开发 一种名为ProteinGenerator (PG)的新型从头蛋白质设计方法， 它 基于RoseTTAFold结构预测网络，利用序列空间扩散来同时生成满足特定序列和结构属性约束的新颖蛋白质序列。 传统的从头蛋白质设计方法通常先生成蛋白质骨架,再用反向折叠方法设计序列，两个步骤是分开的。相比之下，PG能够同时对序列和结构施加偏好和约束，因此可以设计出具有特定序列特征(如氨基酸组成)和结构特征(如对称性)的蛋白质,这在传统方法中很难实现。 这一新方法对于加速功能性蛋白质和新型生物材料的开发具有重要意义。 蛋白质在工业催化、医药、材料等领域有广泛应用，针对特定功能定向设计蛋白质分子一直是合成 ………………………………