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生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-11-07 18:00

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‍ 导语 同学们大家好!今天给大家分享一篇的生信文章“Establishment and validation of the prognostic risk model based on the anoikis-related genes in esophageal squamous cell carcinoma”这篇文章于2024 年 10 月 23 日发表在Ann Med. 期刊上IF=4.9 结果: DE-ARGs 和候选预后标志物的筛选 基于 TCGA 和 GeneCards,作者 分离了 ARGs 表达数据,并在 82 个 ESCC 和 11 个癌旁样本中进行了比较。如火山图所示( 图 1A ), 53 个 DE-ARGs(46 个上调,7 个下调; 补充表 1 )通过差异表达分析进行筛选。 DE-ARG 的热图如图  1B  所示。对 DE-ARGs 进行生存分析,以鉴定 p < 0.005 的候选基因。最终,选择了 PBK 、 LAMC2 、 TNFSF10 和 KL 这 4 个基因进行以下分析。 图 1C-F  显示低 PBK 和 LAMC2 表达组的生存概率低于高表达组,而高 TNFSF10 和 KL 表达组的生存概率低于低表达组。通过 ssGSEA 计算基因集上样本的富集度 ………………………………

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