使用psRNATarget和TAPIR数据库预测植物miRNA的靶基因

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使用psRNATarget和TAPIR数据库预测植物miRNA的靶基因 先前介绍的一些用于预测 miRNA 的靶基因的工具，如 TargetScan 、 miRDB 、 miRNet 、 miRWalk 等，主要都是针对动物构建的数据库（如人、小鼠、果蝇、线虫等）。由于 miRNA 在植物、动物的特点和作用机制不同，先前介绍的这些数据库无法用于植物 miRNA 的靶基因分析。 因此本篇继续介绍两个可以用来预测植物 miRNA 靶基因的数据库， psRNATarget 和 TAPIR 。   使用psRNATarget数据库进行植物miRNA的靶基因预测 psRNATarget 是一个用于识别植物 miRNA- 靶基因相互作用的在线数据库，通过使用预定义的评分模式分析 miRNA 和靶基因之间的互补位点并通过计算未配对能量来评估目标位点的可达性。 进入 psRNATarget 主页（ https://www.zhaolab.org/psRNATarget/home ），点击“ Analysis ”进入 miRNA- 靶基因分析界面。 psRNATarget 提供了三种模式： ………………………………