专栏名称: 生信菜鸟团
生信菜鸟团荣誉归来,让所有想分析生物信息学数据的小伙伴找到归属,你值得拥有!
今天看啥  ›  专栏  ›  生信菜鸟团

【斑马鱼肾脏的单细胞数据集合】:脊椎动物的中性粒与巨噬细胞的分子特征

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2024-10-16 12:30

文章预览

数据集: GEO NCBI ID Age Genotype/Strain Number of Used Samples Initial Number of Cells GSE100910 3–9 months WT; prkdc 6 11,327 GSE112438 not available AB; CD41:GFP 37 13,824 GSE130487 4–12 months WT 1 20,000 GSE150373 8 months WT; runx1 8 39,424 GSE151231 4 months WT; gata2b 9 14,463 GSE166646 adult WT 1 6422 GSE176036 8 months runx1 8 35,178 GSE179401 2 months WT; rag; rag il2rga 9 47,832 GSE190794 4 months GESTALT 10 51,540 GSE191029 adult WT; prkcda; cxcl8 8 20,695 GSE242133 1-1.5 months AB 3 36,600 GSE246039 3 months WT; cebpb 10 105,194 GSE252788 6 months cebpb 2 28,534 这篇文章可以很好地作为多数据集整合的学习样板,作者在正文中提供了详细的参数~ 当然,遗憾之处在于这篇文章并未提供code。 幸运的是,在邮件request code以后作者非常及时地给了回复【代码长达7677行!而且因为数据集较多,谨慎在本地运行哦】,并建议和讲人类肾脏的【Meta-analysis of single-cell and single-nucl ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览