药物发现中鉴定配体结合位点的10种常见方法

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了解小分子配体如何与其靶标结合对于药物发现非常关键，进而可以通过基于结构的设计实现更有效的优化，更好地理解分子药理学的机制。本文列出了工业界用于确定或预测配体结合位点的常用的 10种方法 ，包括：  X射线晶体学 低温电子显微镜（cryo-EM）  竞争分析 核磁共振（NMR）  共价标记  光亲和标记 突变分析和定点诱变 氢/氘交换 (HDX) 和化学或蛋白水解稳定性分析  非变性质谱法  计算建模方法 首先是提供最高可信度预测、精度和分辨率的技术（例如 X 射线晶体学），然后是经济快速的替代方案（ 图 1，按分辨率排序 ）。 图 1. 本文涵盖的方法概述，箭头上的相对位置指示结合位点确定或预测的置信度/精度/分辨率水平。 1. X射线晶体学 X 射线晶体学是一种历史悠久的生物物理方法，可提供有关结合位点结构和配体结合姿势的详细信息 ………………………………