Rosetta Relax工具笔记

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简介 Relax在Rosetta中主要用于进行松弛(Relax)结构的工具。其通过交替使用packer(Rosetta进行侧链优化工具)和minimizer(Rosetta能量最小化工具)来获得结构的最低能量打分的变体。其通常用于对两个不同的结构之间简单比较。因此建议若目的是比较感兴趣的结构，可以运行松弛这些结构。 演示 位于 /demos/tutorials/Relax_Tutorial 我们首先在 Relax_Tutorial 中拷贝所有内容到实验文件夹下（个人不建议直接在demo下直接运行，比较乱，不易于代码整理） #score_jd2.mpi.linuxgccrelease 更具编译方式不同会有不同，我这里是编译的多线程 #若为普通的则为default $ROSETTA3 / bin / score_jd2 . mpi . linuxgccrelease - s 1ubq . pdb - out : suffix _crystal @crystal_score_flags 若需要保留日志记录可以简单的在末尾加 > 1.log 。 ………………………………