专栏名称: 遇见生物合成
1)简述国内外合成生物学与天然产物生物合成相关研究进展,解读最新文献资讯;2)简述学术界那些事,偶尔情怀主义;3)化学与生物学的完美碰撞;4)高校与研究所那些事。
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天津工生所廖小平/马红武NAR | 发布REME平台-推动非天然反应酶挖掘与评估

遇见生物合成  · 公众号  ·  · 2024-06-25 00:13

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在代谢路径设计领域,寻找能够催化非天然反应的候选酶一直是一项非常具有挑战性的工作。虽然现有一些方法可以根据相似反应识别潜在酶,但在反应类型识别和后续酶筛选评估等方面均存在不足,难以有效地帮助实验科学家快速筛选候选酶进行实验验证。 近日, 中国科学院天津工业生物技术研究所生物设计中心发布了首个集成的反应酶挖掘与评估平台——REME。 (https://reme.biodesign.ac.cn) 该平台结合底物原子到产物原子映射、原子类型变化识别和反应相似性计算,实现了相似反应的计算、快速排序和可视化。用户可以根据功能基团筛选相似反应,并进一步通过酶号或序列同源性筛选或扩展候选酶。REME平台结合多种人工智能方法对候选酶进行多角度评估(如kcat、Km、最佳温度和pH),帮助科研人员迅速识别潜在酶。REME平台的推出为非天然反应的 ………………………………

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