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GPB:广西医科大学安三奇开发单细胞m6A修饰定量新方法

甲基化  · 公众号  ·  · 2024-07-12 18:20

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2024年6月7日,Genomics, Proteomics & Bioinformatics (GPB)上发表了广西医科大学安三奇等人为“Scm6A: A fast and low-cost method for quantifying m6A modifications at the single-cell level”的研究论文,该 研究成功开发了一种名为Single-cell m6A Analysis(Scm6A)的新型计算方法 ,文章第一作者在读博士生李玥琪将在此详细介绍该方法。该方法主要利用机器学习技术,能够快速且低成本地预测单个细胞中的m6A修饰水平,利用普通单细胞转录组数据对单细胞水平上对N6-甲基腺苷(m6A)修饰的定量分析领域取得了新的进展。 目前研究普遍认为N6-甲基腺苷(m6A)具有显著的细胞间特异性,但现有的m6A检测方法并不能从纯计算的角度实现单细胞水平m6A的定量分析。 研究方法: 利用机器学习方法构建Scm6A模型,并利用MACS、m6A-seq、scRNA-seq等方法,反复验证Scm6A模型的快速、稳健、准确的性能。 主 ………………………………

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