专栏名称: RNAScript
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你必须知道的mRNA疫苗5'UTR序列筛选流程

RNAScript  · 公众号  ·  · 2024-06-19 16:41
    

主要观点总结

中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所的冯霞课题组在Research Square上发布了关于mRNA疫苗优化工作的预印本文章。文章主要围绕设计不同的5'UTR序列来驱动报告基因和HIV gp145基因表达进行研究,并采用生物信息学平台进行预测分析。文章还提到一些有趣的现象和关键点,如质粒和mRNA驱动蛋白表达的不相关性、5'UTR二级结构与帽结构距离对mRNA蛋白表达效率的影响等。最终确定了不同细胞系中不同5'UTR序列的蛋白表达情况,并讨论了相关机制和未来研究方向。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景及目的

文章主要介绍了中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所的冯霞课题组在mRNA疫苗优化方面的工作,旨在通过设计不同的5'UTR序列来优化mRNA疫苗的表达效果。

关键观点2: 研究过程和方法

研究人员设计了五种不同的5'UTR序列,分别驱动报告基因和HIV gp145基因表达,并依据蛋白表达效率和水平筛选出表达最佳的5'UTR序列。同时,利用生物信息学平台预测了不同mRNA构建体中5'UTR区的二级结构等。

关键观点3: 研究发现及关键现象

研究发现质粒驱动的蛋白表达和mRNA驱动的蛋白表达不具有相关性。同时,还发现5'UTR序列的二级结构与帽结构的距离对mRNA的蛋白表达效率有极大影响。

关键观点4: 研究结果及验证

研究确定了不同细胞系中不同5'UTR序列的蛋白表达情况,并讨论了相关机制和未来研究方向。同时,也提到了研究中确定的最佳5'UTR序列为β-globin-5'UTR。

关键观点5: 行业展望与反思

文章指出在mRNA治疗领域的合作交流的重要性,并提到了AI技术在未来可能的应用。同时,也强调了同一个UTR序列在面对不同的靶标基因和转染细胞时可能表现出的完全不同蛋白表达效率,使得UTR序列筛选成为一个复杂且耗时的工程。


文章预览

近日, 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所冯霞课题组 在 Research Square 上传预印本文章: Optimization of the 5ʹ untranslated region of mRNA vaccines. 这项工作本身并无新颖之处,采用的也是常规方法,设计 5 种不同的 5'UTR 序列分别驱动报告基因和 HIV gp145 基因表达,依据蛋白表达效率和水平,从中筛选出表达最佳的 5'UTR 序列。值得关注的是,他们发现了两个非常有趣的现象: (1)相同的 5'UTR 在质粒和 mRNA 上驱动相同基因表达时,检测到的细胞内蛋白表达水平是完全不相同的。也就是说,你 利用质粒作为表达载体筛选出的最佳 UTR 不一定适用于 mRNA。 (2)证实 5' UTR 二级结构与帽结构 (cap) 之间的距离极大地影响 mRNA 的蛋白表达效率。 确定候选 5'UTR 序列 这项工作总共挑选了 5 种候选 5'UTR 序列: α-globin-5'UTR 和β-globin-5'UTR  选自人体细胞中高表达基 ………………………………

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