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血浆中细胞游离DNA(cfDNA)的片段化模式已被证明与cfDNA的起源组织密切相关,并与核小体结构有关。已有研究利用血浆染色质免疫沉淀测序(cfChIP-seq)证明了细胞游离核小体(cf-核小体)存在组蛋白修饰(组蛋白H3赖氨酸4三甲基化,H3K4me3)。据报道,分析cf-核小体的组蛋白修饰可以帮助检测转移性结直肠癌(CRC)和肺癌患者;使用基于免疫沉淀的方法靶向组蛋白修饰(例如组蛋白H3赖氨酸27乙酰化,H3K27ac)和DNA甲基化,可以推断诊断标记物和药物靶点的表达水平。然而,免疫沉淀增加了实验的复杂性和分析的周转时间。此外,免疫沉淀过程中可能有DNA丢失。因此,在利用片段组学特征分析cfDNA起源组织以及评估各种组织对血浆的贡献方面,仍有很大的发展空间。 为了探索利用cfDNA分子的片段化模式来推断组蛋白修饰相关信号的可行性, 香港中文
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