专栏名称: 生信分析手册
分析生信文献,学习生信分析知识,专注生信分析最前沿。
今天看啥  ›  专栏  ›  生信分析手册

7+WGCNA+机器学习+PPI+分子对接,想要高分可以这么做!抓紧上车卷一篇!!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-07-10 10:57
    

文章预览

‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Characterizing hub biomarkers for post-transplant renal fibrosis and unveiling their immunological functions through RNA sequencing and advanced machine learning techniques”,这篇文章发表在 J Transl Med 期刊上,影响因子为7.4。 结果: 使用WGCNA和差异表达分析进行筛选 为了建立临床信息和关键基因之间的联系,进行了WGCNA分析。样本显示出稳健的聚类,没有异常值。拓扑计算采用了从1到20的软阈值幂进行,确定了最佳软阈值幂为11(图1a)。利用这个软阈值幂,相关矩阵经过转换成邻接矩阵,然后转换成拓扑重叠矩阵(TOM)。利用TOM进行平均连接层次聚类,用于分类相关的基因模块,每个模块至少包含30个基因(图1b)。合并相似的基因模块,得到了六个模块的识别结果(图1c)。 交集基因的富集分析 为了揭示驱动肾纤维化发展的潜在生物学机制 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览