NatGenet | 细胞注释新工具，使用 popV 在单细胞数据中进行细胞类型标签的共识预测

文章预览

Basic Information 英文标题： Consensus prediction of cell type labels in single-cell data with popV 中文标题：使用 popV 在单细胞数据中进行细胞类型标签的共识预测 发表日期：20 November 2024 文章类型：Article 所属期刊：Nature Genetics 文章作者：Can Ergen | Nir Yosef 文章链接：https://www.nature.com/articles/s41588-024-01993-3 Abstract Para_01 细胞类型分类是单细胞测序分析中的关键步骤。 已经提出了多种方法将细胞类型标签从注释的参考图谱转移到未注释的查询数据集中。 现有的细胞类型标签转移方法缺乏对结果注释的适当不确定性估计，限制了可解释性和实用性。 为了解决这个问题，我们提出了一种流行投票（popV）方法，这是一种基于本体的投票方案的预测模型集合。 PopV 实现了准确的细胞类型标记，并提供了不确定性分数。 在多个案例研究中，popV 能够自信地注释大多数细胞 ………………………………